Bourguillon était au Moyen Age le refuge imposé aux bourgeois atteints de la lèpre. Perchée sur une colline surplombant la Sarine et Fribourg, la chapelle de pèlerinage, mélange de baroque et de gothique, date de 1433. Sa célèbre statue de Marie, de 1466. Précédemment, une chapelle romane était vraisemblablement rattachée à l'hôpital (ancienne léproserie).

Le plan actuel est celui de la chapelle construite de 1464 à 1466, dont le chœur a été conservé. En 1659, une sacristie fut ajoutée sur le côté nord. De 1759 à 1761, la nef fut remaniée dans le style baroque.