En forme de proue de bateau, la cour intérieure fut construite par le fils du célèbre Amiral Duquesne, en hommage à son père. Le cœur de l'Amiral est inhumé dans le temple d'Aubonne. Entourée de colonnes en molasse, le sol de la cour intérieure présente un pavage en galets posé en 1677, avec des motifs rappelant ceux d'un tapis persan.

On peut voir dans le fond un petit monument (bas relief) montrant deux gladiateurs.