Mise en service en 1874 par la compagnie du L-E, le premier bâtiment de la station est en bois.

Lors des années 1912-1913, le bâtiment en bois d'origine est remplacé par une construction en maçonnerie. Le style fut celui si typique de la fin du L-E et du LEB. En effet, les bâtiments des gares de Romanel, Cheseaux, Assens et Échallens notamment étaient identiques du point de vue architectural.

Actuellement, la halte d'Étagnières est la dernière avec celle d'Assens à disposer d'un bâtiment construit dans ceux de la série des années 1910.